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全球人类微生物组临床试验活动概述 | 食药并进,三足鼎立

尽管目前“健康的微生物组”这个概念还有待定义,但微生物组却与一系列疾病息息相关。微生物组紊乱与疾病的因果关系一旦确立,将会给若干疾病的治疗指出更多新的研究方向。无论是在营养或在制药方面的应用,目前欧洲都处于微生物组研究的最前沿,并且会在未来持续发挥重要作用。

从2000年到2017年,在clinicaltraisl.gov数据库记录在案的约2100例微生物组的临床试验中,有35%的研究是在欧洲进行的,美国紧随其后,包揽了33%的研究。中国虽排在第三位,但却只占了研究总数的5%。不过,中国的这一数字其实被低估了。因为当把中国药监局药品审评中心记录在案的试验也纳入时, 中国的微生物组临床试验翻了一番,占比上升至10%。

欧洲于2000年首次在临床试验中涉及微生物组,而美国和中国则是相继在2006年和2009年开始相关研究。来自PubMed的数据显示,在2006-2017年发表的有关微生物组的论文中,有32%来自欧洲,23%来自美国,9%来自中国。

起初,微生物组的研究领域主要集中在肠胃疾病(肠易激综合征,炎性肠病和克罗恩病)和代谢疾病(肥胖和糖尿病)。在2006至2017年间,这两个领域分别占据欧美微生物组试验总数的20%(肠胃疾病)和15%(代谢疾病)。

近年来,微生物组的潜在应用已扩展到其他治疗领域。从clinicaltrials.gov上的数据来看,中枢神经系统疾病、传染病和肿瘤学是进展最快的领域。其中,欧洲的肿瘤学临床试验数量(包含微生物组分析)自2011年来每年同比增长41%。但它的绝对数量却仍然落后于美国。 这是因为自2000年以来,美国进行的肿瘤相关的微生物组试验占试验总数的7%,而这一数字在欧洲只有2%。

目前,第一种基于微生物组的治疗方案已经问世,即“粪菌移植(FMT)”,它是指通过将健康捐赠者的肠道菌群引入患者体内,达到治疗疾病的目的。FMT不仅已成功地用于治疗艰难梭菌感染(CDI),它也能调整化疗等重症治疗后的引起的肠道生态失调问题。例如Maat Pharma、OpenBiome、和Rebiotix等生物技术公司目前正着手开发FMT治疗方案。FMT需要从生物库中获取特定的健康粪便样本,但各国对于FMT的相关法规却各不相同。在美国,它被归类为生物制品和仅用于CDI的药物。在加拿大,它被作为一种新的生物药物注册,且其仅限于临床试验使用。 欧洲各国并没有统一监管,仍在各自完善相关法规的过程中。在法国,FMT被视为药物,除非特殊情况,FMT只能在临床试验中使用。然而在英国,国家健康和护理卓越研究所(NICE)允许在NHS(国家卫生服务)中对传统疗法无效的复发性艰难梭菌感染患者进行FMT治疗。在未来,随着临床试验市场规模的扩大,各国监管机构应当重新审视关于FMT治疗方案的法规。

除了FMT之外,制药行业还对“噬菌体疗法”、抗菌肽和治疗辅助剂等其他微生物组治疗方案展现出了兴趣。

将眼光放在微生物组上的玩家并不仅来自于制药领域。事实上,食品行业也在积极开展对微生物组的研究,并在微生物组临床试验的兴起中占有重要地位。2008年,欧洲含有“微生物组”关键字的15项临床试验中,有14项与食品行业紧密相连。此外,欧洲有57%的微生物组研究来自于食品行业,在同一时期的美国,食物微生物组试验累计占总微生物组试验的43%。到了2017年,欧美约半数的微生物组临床试验都与食品行业相关。

食品行业对微生物组的兴趣点主要聚焦在益生菌和益生元的开发。这些临床试验还研究不同饮食(如西方饮食、地中海饮食、素食饮食或无麸质饮食等)对微生物组的影响。然而,由于欧洲食品安全局(EFSA)在2012年加强了对保健功效声明的监管,食品临床研究的数量陷入停滞不前的状态。在这种情况下,Pileje等食品公司开始另辟蹊径,将它们的产品作为药物,并遵循与药物研发相同的流程进行相关临床研究,以证明其产品的功效和安全性。

除了健康功效的研究,微生物组研究还在食品行业还衍生出了另一个领域:食品安全。研究的方向包括:如何利用食品生产中的微生态系统优化产品的感官风味?如何控制腐败细菌?食品保质期和微生物活动之间有什么样的关系?与此同时,行业内也在研究如何应用噬菌体或抗菌肽(AMPS)等先进技术靶向性地防止不良细菌的定植(生物防腐)。

制药和食品行业对微生物组与人类健康关联性的兴趣正在日益剧增。得益于其对新生物技术公司的支持和微生物组的产品的开发,欧洲目前处于人类微生物组研究方面的前列。不过在美国和世界各地,与人类微生物组相关的研究活动和临床试验也正在蓬勃发展。无论是在制药行业还是食品行业,随着对人体菌群(及其临床应用)的研究兴趣和参与度的不断升温,人们对这个主题也有了更深刻的理解。在未来,制药和食品行业可能会分享他们的微生物组发现,并合作创立标准化方法以便更好地了解微生态系统及其作用。

数据来源

[1]  Clinicaltrials.gov网站(截止于2018年1月)
[2]  PubMed网站(截止于2018年1月)
[3]  中国国家药品监督管理局药品审评中心网站(截止于2018年1月)

参考文献

[1]  人类微生物组计划网站
[2]  Païssé S, Valle C, Servant F, Courtney M, Burcelin R, Amar J, Lelouvier B. (2016) Comprehensive description of blood microbiome from healthy donors assessed by 16S targeted metagenomic sequencing. Transfusion. 56:1138-47. doi: 10.1111/trf.13477.
[3]  Aragón IM, Herrera-Imbroda B, Queipo-Ortuño MI, Castillo E, Del Moral JS, Gómez-Millán J, Yucel G, Lara MF. (2016) The Urinary Tract Microbiome in Health and Disease. Eur Urol Focus. pii: S2405-4569(16)30159-6. doi: 10.1016/j.euf.2016.11.001.
[4]  Nguyen LD, Viscogliosi E, Delhaes L (2015) The lung mycobiome: an emerging field of the human respiratory microbiome. Front Microbiol. 13;6:89. doi: 10.3389/fmicb.2015.00089.
[5]  Kumar A, Chordia N (2017) Role of Microbes in Human Health. Appli Microbiol Open Access 3:131. doi:10.4172/2471-9315.1000131

英文作者

■ Etienne Casal 梅里埃营养科学集团 执行副主席
■ Murielle Cazaubiel 梅里埃营养科学集团 欧洲临床研究中心 总经理(时任)
■ Françoise Le Vacon 梅里埃营养科学集团 欧洲临床研究中心 首席科学官
■ Alessandra De Martino 梅里埃营养科学集团 欧洲临床研究中心 战略市场经理

中文编辑 | 刘洋、万林
审稿 | 李定强